Le Musée annexé à l’Opificio delle Pietre Dure, aujourd’hui centre spécialisé dans la restauration, est l’héritier direct de la Manifattura di corte, fondée officiellement en 1588 par Ferdinando I de’ Medici, où s’effectuait le travail des pierres dures.
La physionomie du Musée, fondé en 1882, ne répond pas à une intention de collection précise, mais reflète plutôt la vie et l’histoire de l’activité productive séculaire. Les créations les plus prestigieuses, souvent offertes en cadeau par les grands-ducs de Florence, sont conservées dans les résidences royales et dans les musées de toute l’Europe, tandis que dans les ateliers de production du musée sont restées des œuvres inachevées, des pièces modifiées ou démontées dans le temps, ainsi que ce qui a survécu aux dispersions du XIXe siècle. La collection, composée de pièces de grande suggestion et raffinement, suffit néanmoins à retracer le parcours historique de la manufacture qui s’étend sur trois siècles. On y conserve également un important ensemble de marbres anciens et de pierres dures.
Le Musée a été rénové en 1995, sur un projet de Adolfo Natalini. Le réaménagement de la collection, dirigé par Anna Maria Giusti, suit un critère thématique : dans les salles issues du grand salon sont présentées les productions du période grand-ducale médicéenne et lorraine, tandis que dans les petites salles du XIXe siècle sont exposées celles de la période post-unitaire. Le niveau supérieur du salon est dédié aux techniques de travail : du riche échantillonnage lapidaire, aux établis, aux outils, jusqu’à l’illustration didactique de certaines phases de la production d’incrustations et de sculptures. On peut ainsi retracer le processus complet, de l’idée jusqu’à l’œuvre achevée, et découvrir les mécanismes les plus intimes d’un chapitre fascinant de l’histoire artistique florentine.